針對陽明校務會議投票結果，國立清華大學表示，尊重陽明的決議，並對陽明及交大的合校成功給予祝福。清華與陽明、交大、中央四校同為台聯大系統，仍將持續教學與研究的合作。

清華大學表示，合校的校名確實是陽明考慮的因素，清華尊重陽明的選擇。賀陳弘校長已在第一時間向陽明郭校長及交大張校長表達恭喜與祝福。

清華大學也表示，發展醫學、生醫等領域，是清華大學發展為世界一流大學的路程上未曽間斷的努力。過去數個月來與陽明的互訪與對話，更加強這方面的認識。清華在與新竹教育大學合校後，增加了教育、藝術兩大學院，提供學生更全面的跨領域教育，在學校的長期發展方向上，致力於建立台灣高教新典範。清華大學將持續拓展前景，包括與所有醫學大學合作或發展學校醫學院。